关于影片的结局，其实也是争议最大的地方，但在陈忱看来，这也是该片最具有“新海诚式”特色的地方。

有些观众选择“世界”，像影片中的须贺一样，理解但不认同男主角的选择，认为男主角应该更理智而顾全大局；同时也有观众非常认同男主角“选择爱人”的做法，认为爱情就应该这样纯粹而热烈，甚至表示这样的选择让人“找回了失去的爱与勇气”。

“在‘世界系’类型的故事里纯粹而天真的爱情、‘对方’和‘世界’之间非此即彼的选择非常容易与观众建立连接成为推动剧情的矛盾，同时大部分该类型故事的结局也很符合当下主流的伦理观——牺牲小我实现大我，这也是为什么《天气之子》的结局两极分化的原因，因为它与主流的观点背道而驰。或许是我们看惯了如今超级英雄电影舍小家为大家的主题后，偶尔这种的价值观结尾会有些不适应。但在我看来，这个结局我不一定百分百支持，但却十分理解。”