今天的埃及博物馆是开罗埃及文物藏品的第五个家。首批文物展出于1835年，地点位于开罗市中心的阿兹巴基亚公园（Azbakiya Gardens）。随后，它们被重新安放在萨拉丁城堡（Saladin’s Citadel）的展厅内。1855年，埃及总督赛义德（Khedive Said Pasha）将这批馆藏作为礼物赠与奥地利大公马克西米利安（Maximilian）。法国埃及学家奥古斯特·马里耶特在尼罗河岸边的布拉克（Bulaq）展出了第三批藏品。1878年，尼罗河洪水威胁到了布拉克的展馆和文物，它们又被搬迁至第四个地点，位于吉萨（Giza）的伊斯梅尔（Ismail）总督行宫的一座附属建筑内。

1902年11月15日，在总督阿拔斯·希尔米（Abbas Helmi）的统治时期，现在位于解放广场的博物馆在加斯东·马斯佩罗（Gaston Maspero）的指挥下竣工。最初博物馆的藏品数量约有50000件，目前馆内所藏文物已超过150000件。每一件文物都会被录入数据库，以确保馆员们能够保持记录更新，以及帮助学者们获取研究所需的信息。大多数通过发掘、购买和没收而获得的文物都会被运至埃及博物馆，在这里展出或者保存。如今，新出土的文物会就近保存在地方博物馆内，这样的博物馆目前全埃及有27家。

埃及博物馆拥有世界上最精美且丰富的古代埃及文物馆藏。这里有来自古王国时期的藏品，例如哈夫拉（Khafre）、孟卡拉（Menkaure）、拉霍特普（Rahotep）、诺夫瑞特（Nofret）、卡培尔（Ka-aper）等人的雕像，以及塞奈布（Seneb）与家人的雕像。此外，还有在胡夫（Khufu）的母亲海特夫瑞斯（Hetepheres）的墓中出土的文物，包括她的伞盖、床、凳子、轿椅以及棺椁，它们在博物馆一层的一间特别的展厅展出。

这里有来自中王国时期的藏品，例如孟图霍特普（Mentuhotep）的雕像，麦斯提（Mesehti）的模型，麦克特瑞（Meketre）的模型，塞努斯瑞特二世（Senusret II）和阿蒙奈姆赫特三世（Amenemhet III）的雕像，以及克努姆特（Khnumet）公主、斯特哈托尔（Sit-Hathor）、斯特哈托尔伊乌奈特（Sithathoriunet）、麦瑞瑞特（Mereret）、乌瑞特（Weret）、伊塔（Ita）、伊塔乌瑞特（Ita-Weret）、奈菲鲁普塔（Neferuptah）等人的饰品。

新王国时期的藏品有阿赫霍特普（Ahhotep）的饰品，哈特舍普苏特（Hatshepsut）、塞内穆特（Senenmut）、图特摩斯三世（Thutmose III）和阿蒙霍特普三世（Amenhotep III）的雕像，尤雅（Yuya）和图雅（Tuyu）的文物，哈普（Hapu）之子建筑师阿蒙霍特普、埃赫那吞（Akhenaten）和奈菲尔提提（Nefertiti）的雕像，以及拉美西斯二世（Ramesses II）、纳赫特敏（Nakhtmin）和其妻子的雕像。图坦卡蒙的珍宝在楼上东侧长廊、北侧室和三号厅内展出。关于古埃及晚期，博物馆有幸展出于1939—1940年出土自塔尼斯的珍宝。这批珍宝包括来自不同时期的珠宝首饰共计超过600件，目前安放在环境良好的展柜中展出