冬季是苹果树休眠期，也是苹果树害虫、病菌的潜伏越冬期，这时病虫的越冬场所比较集中，龄期较一致，是果树病虫害集中防治不可忽视的时期。搞好果树休眠期的病虫防治，减少越冬病虫基数，可有效减少来年病虫害的发生，为来年苹果园的管理打下良好的基础。
病菌
腐烂病病菌在树的病皮内越冬，或者是以菌丝的形态在病疤的木质部越冬；干腐病、轮纹病病菌在病组织内越冬；炭疽病病菌在病枯枝、僵果处越冬；斑点落叶病、褐斑病病菌主要在病叶或枝条病斑处越冬；白粉病病菌在芽鳞间或鳞片内越冬。绣线菊蚜、苹果瘤蚜以卵在芽腋、芽旁或树皮缝隙内越冬。