雅鲁藏布江的鱼类相对于其他区系而言，种类比较少，大多属于高山冷水鱼，生长缓慢，性成熟期较晚，种群对环境的依赖性很强，鱼类分布江段区分非常明显，优势鱼种具有触须，以刮食藻类和水生昆虫为食。修长健美体型的裂腹鱼，岩石般斑驳纹理的墨头鱼，乌青的四须鲃，这就是雅鲁藏布江鱼类的原始野性之美。
雅鲁藏布江的鱼类 摄影/ 谢罡
雅鲁藏布江上游为马泉河（又称狮泉河、象泉河），水源主要来自高山冰雪融化后的冷水，河谷是重要的牧场，有些草甸和湖泊，鱼类有裂腹鱼和高原鳅。
雅鲁藏布江中游有6种裂腹鱼：异齿裂腹鱼、拉萨裂腹鱼、双须叶须鱼、巨须裂腹鱼、拉萨裸裂尻鱼、尖裸鲤；有三种高原鳅属鱼类：东方高原鳅、细尾高原鳅、异尾高原鳅；两种鮡科鱼类：黑斑原鮡、黄斑褶鮡。裂腹鱼是我国西藏地区特有的珍稀高原经济鱼类，异齿裂腹鱼被评选为“雅鲁藏布江生物名片”，尖裸鲤仅在仁布以上江段出现。