尽管新生儿重症监护医学最近取得了进展，但一些新生儿疾病，包括早产儿的支气管肺发育不良（BPD）、严重脑室出血（IVH）、缺氧缺血性脑病（HIE）和坏死性肠炎（NEC），仍然是主要的死亡原因。因此，迫切需要开发新的安全有效的治疗方法来改善这些难治性和破坏性的新生儿疾病。
近年来，随着对肺发育、发病和修复机制中的生理作用的深入研究，发现了肺部器官特异性未分化干/祖细胞群体，为再生医学领域的研究打开了新的大门。
支气管肺发育不良（BPD）
支气管肺发育不良（BPD）是早产儿的一种慢性肺部疾病，经过补充氧气和机械通气治疗。干细胞疗法被视为预防和治疗BPD的有前途的创新疗法之一。肺脏存在的干/祖细胞包括内皮细胞、间充质细胞和上皮细胞。内皮祖细胞通过归巢到损伤部位参与血管修复和再生，以恢复内皮完整性和安全的组织灌注。
BPD患儿的脐血中内皮祖细胞的数量下降，这也提示内皮祖细胞的数量减少可能与新生儿BPD的肺血管不成熟有关。同样，气管抽吸物中含有脱落的MSC的婴儿比那些气管抽吸物中不含的婴儿更有可能发生BPD，可能在于肺部发育过程中出现了MSC的脱落，导致肺部MSC不能很好地支持肺部的发育。但是也有研究显示BPD患儿的脐血中造血干细胞和MSC的数量增多，而且与BPD疾病的严重程度呈正相关，不过BPD患儿脐血里面的粒细胞集落刺激因子（G-CSF）减少。